Coarse-Grained Modelling of DNA and DNA Self-Assembly (Springer Theses) （2012）

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Coarse-Grained Modelling of DNA and DNA Self-Assembly (Springer Theses) （2012）

Ouldridge, Thomas E.

ウェブストア価格 ¥23,074（本体¥20,977）
Springer-Verlag Berlin and Heidelberg GmbH & Co. K（2014/08発売）
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製本 Paperback:紙装版/ペーパーバック版／ページ数 176 p.
商品コード 9783642436529

Full Description

This thesis presents a novel coarse-grained model of DNA, in which bases are represented as rigid nucleotides. The model is shown to quantitatively reproduce many phenomena, including elastic properties of the double-stranded state, hairpin formation in single strands and hybridization of pairs of strands to form duplexes, the first time such a wide range of properties has been captured by a coarse-grained model. The scope and potential of the model is demonstrated by simulating DNA tweezers, an iconic nanodevice, and a two-footed DNA walker — the first time that coarse-grained modelling has been applied to dynamic DNA nanotechnology.

A Novel DNA Model.- Methods.- Finite Size Effects.- Structural and Mechanical Properties of Model DNA.- Thermodynamic Properties of Model DNA.- Modelling DNA Tweezers.- Modelling a DNA Walker.