Data Integration, Manipulation and Visualization of Phylogenetic Trees (Chapman & Hall/crc Computational Biology Series)

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Data Integration, Manipulation and Visualization of Phylogenetic Trees (Chapman & Hall/crc Computational Biology Series)

Yu, Guangchuang

ウェブストア価格 ¥28,429（本体¥25,845）
Chapman & Hall/CRC（2022/08発売）
外貨定価 US$ 126.99
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製本 Hardcover:ハードカバー版／ページ数 255 p.
言語 ENG
商品コード 9781032233574
DDC分類 576.88

Full Description

Data Integration, Manipulation and Visualization of Phylogenetic Trees introduces and demonstrates data integration, manipulation and visualization of phylogenetic trees using a suite of R packages, tidytree, treeio, ggtree and ggtreeExtra. Using the most comprehensive packages for phylogenetic data integration and visualization, contains numerous examples that can be used for teaching and learning. Ideal for undergraduate readers and researchers with a working knowledge of R and ggplot2.

Key Features:

Manipulating phylogenetic tree with associated data using tidy verbs
Integrating phylogenetic data from diverse sources
Visualizing phylogenetic data using grammar of graphics

1. Importing Tree with Data, 2. Manipulating Tree with Data, 3. Exporting tree with data, 4. Phylogenetic Tree Visualization, 5. Phylogenetic Tree Annotation, 6. Visual Exploration of Phylogenetic Tree, 7. Plotting tree with data, 8. Annotating Tree with Silhouette Images and Sub-plots, 9. ggtree for other tree-like objects, 10. ggtreeExtra for presenting data on a circular layout, 11. Other ggtree extensions, 12. ggtree utilities, A. Frequently asked questions, B. Related tools, Figures and Tables Publications of the ggtree package suite, References, Index