出版社内容情報
☆ゲノム創薬研究の第一線の研究者による国内初の成書
☆21世紀の創薬研究の中心となる“ゲノム創薬”
☆患者ごとに最適な薬剤投与を行うテーラーメイド医療を支える“ゲノム創薬”
執筆者一覧(執筆順)
野口照久 ゲノム創薬フォーラム代表
テノックス研究所 所長 代表取締役
古谷利夫 (株)ファルマデザイン 代表取締役社長
東京大学 分子細胞生物学研究所 客員教授
小原 收 かずさDNA研究所 ヒト遺伝子研究部長
菅野純夫 東京大学医科学研究所 癌ウィルス研究所 助教授
内田和彦 筑波大学 基礎医学系 生化学
村松正明 ヘリックス研究所 部長研究員
村上康文 東京理科大学 基礎工学部 生物工学科 教授
藤 博幸 生物分子工学研究所 情報解析研究部門 部門長
西村俊秀 グラクソ・ウエルカム(株)筑波研究所 プロテオミクス課長
川上隆雄 グラクソ・ウエルカム(株)筑波研究所 プロテオミクス課 研究員
荻原 淳 グラクソ・ウエルカム(株)筑波研究所 インフォマティクス課長
松尾 洋 (株)ファルマデザイン 取締役 研究開発担当
有國 尚 サイファージェン・バイオシステムズ(株) 鎌倉研究所所長
斉藤賢治 サイファージェン・バイオシステムズ(株) 鎌倉研究所所 主任研究員
伊藤 晋 中外製薬(株) 化学研究所
横山茂之 東京大学大学院 理学系研究科(生物化学専攻) 教授
理化学研究所 ゲノム科学総合センター タンパク質構造・機能研究グループ プロジェクトリーダー
理化学研究所 播磨研究所 細胞情報伝達研究室 主任研究員
廣田 洋 理化学研究所 ゲノム科学総合センター タンパク質構造・機能研究グループ
基礎構造機能研究チーム・チームリーダー
中山朋子 理化学研究所 ゲノム科学総合センター タンパク質構造・機能研究グループ
テクニカルスタッフ
藤田芳司 グラクソ・ウエルカム(株) 研究本部長
隅蔵康一 東京大学先端科学技術研究センター・知的財産権大部門 助手
新井賢一 東京大学医科学研究所 所長 分子細胞制御研究部 教授
構成および内容
序章 野口照久
1. ゲノム創薬のパラダイム
2. ゲノム情報からゲノム創薬へ
3. ゲノム創薬の将来展望
第1章 ゲノム創薬の展望 古谷利夫
1.はじめに
2.ゲノム創薬とは -従来の創薬との大きな違い-
3.おわりに
第2章 ヒト長鎖cDNA解析 小原 收
1.はじめに
2.かずさcDNAプロジェクト ~ヒト長鎖cDNA配列解析~
3.長鎖cDNAとそれにコードされる蛋白質の特徴
4.かずさ長鎖cDNAプロジェクトの実際
5.長鎖cDNA解析の成果
6.将来の展望
第3章 完全長cDNA技術 菅野純夫
1.はじめに
2.オリゴキャップ法の開発経緯
3.オリゴキャップ法の実際
4.EST特許・完全長cDNA特許
5.タンパク質機能解析
6.将来の展望
第4章 遺伝子発現頻度解析;DNAマイクロアレイ 内田和彦
1. はじめに
2. ゲノムサイエンスとPharmacogenetics,Pharmacogenomics
3. PharmacogenomicsにおけるDNAマイクロアレイとゲノム創薬
4. 遺伝子発現モニタリングと創薬
5. ゲノムテクノロジーとしてのDNAマイクロアレイ
5.1 オリゴヌクレオチドアレイ(オンチップDNA合成)
5.2 スポット式マイクロアレイ
5.3 プローブのデザイン
5.4 マイクロアレイ
5.5 マイクロアレイWebサイト
6. バイオインフォマティクス
7. ゲノム創薬におけるPharmacogenetics
8. おわりに
第5章 核内タンパク質の移行メカニズムと発見技術 村松正明
1.はじめに
2.核と細胞質の間の輸送機構
2.1 核への輸送
2.2 核からの輸送
3.機能的ゲノム研究手法の重要性
4.核移行トラップ法(Nuclear Transportaion Trap;NTT法)
5.おわりに
第6章 モデル生物ゲノム情報の利用とゲノム多型の解析 村上康文
1. はじめに
2. ゲノム解析計画が生み出す配列情報
3. モデル生物ゲノム解析研究の意義とその現状
4. 出芽酵母ゲノム解析で明らかになったこと
5. モデル生物ゲノム解析データの創薬への応用
6. 創薬とゲノム多様性
7. まとめ
第7章 バイオインフォマティクス 藤 博幸
1. はじめに
2. 生命現象の階層性とバイオインフォマティクス
3. 相同アミノ酸配列比較の発展
4. おわりに
第8章 プロテオーム解析 西村俊秀、川上隆雄、荻原淳
1. はじめに
2. プロテオーム技術の開発経緯
3. タンパク質の高分解能分離および画像解析
3.1 二次元電気泳動法
3.2病態プロテオミクス
4. マスプロテオメトリー
5. タンパク質リンケージマップ(Protein linkage map)
6. タンパク質の機能解析 -バイオインフォマティクス-
7. おわりに
第9章 構造ゲノム科学 松尾洋
1. 構造ゲノム科学前史
2. 構造ゲノム科学の概要
3. 構造ゲノム科学におけるバイオインフォマティクス
4. 構造ゲノム科学と機能ゲノム科学
5. 構造ゲノム科学とSNPsプロジェクトの統合
6. おわりに
第10章 SELDIプロテインチップシステム 有國 尚、斉藤賢治
~創薬のためのバイオマーカー探索技術~
1. はじめに
2. SELDIプロテインチップ技術
3. タンパク質バイオマーカーの探索と分析の手法
4. SELDIプロテインチップ技術を用いたマーカー探索
5. SELDIプロテインチップ技術を用いたマーカー探索の応用例
5.1前立腺ガン
5.2 卵巣ガン
5.3 神経膠腫
5.4 RXRリガンド作用機構の解析
6. SELDIプロテインチップ技術による相互作用解析
7. SELDIプロテインチップ技術による相互作用解析の応用例
7.1 アルツハイマー病(Amyloid-βアッセイ)
7.2 脳内レセプターのリガンド同定
7.3 機能未知なタンパク質の相互作用解析
8.プロテオーム解析の現状と問題点
第11章 タンパク質結晶構造解析をめぐる技術の進歩と創薬 伊藤 晋
1. はじめに
2. X線回折測定装置
3. シンクロトロン放射光
4. Flash Cooling
5. 多波長異常分散法
6. コンピューターの高速化と低価格化
7. 分子モデルの最適化
8. Free Energy Perturbation
9. おわりに
第12章 NMRによるタンパク質基本構造解析 横山茂之・廣田 洋・中山朋子
1. はじめに
2. タンパク質基本構造解明計画
3. タンパク質の基本構造の重要性
4. タンパク質基本構造解析の具体的方策
5. NMRによる基本構造解析 -全体の流れと諸課題-
5.1 分子量限界の克服(高感度化、高分解能化、新測定法)
5.2 NMRスペクトル解析の自動化
5.3 安定同位体標識法の改良
6. おわりに
第13章 ファーマジェノミックスとSNPs 藤田芳司
1. はじめに
2. SNPsとは?
3. SNP解析技術の現状と課題
4. ファーマコジェノミックスの現状
5. おわりに
第14章 ヒトゲノム特許戦略 隅藏康一
1. 2000年初頭のゲノム関連株価
2. DNA特許の歴史
2.1 全長遺伝子 2.2 EST
3. 米国における最近の動き
3.1 Written Descriptionガイドライン
3.2 Utilityガイドライン
3.3 セレーラ社のビジネス戦略
3.4データーベース保護法を巡る動向
3.5 バイオインフォマティクス特許とTC1631
3.6 ポストゲノム時代の特許問題
4. 今後の日本企業のヒトゲノム戦略
第15章 ゲノム医科学の展開と21世紀のゲノム医療の展望 新井賢一
1. はじめに
2. ジグナル伝達ネットワークと構造生物学の課題
3. ゲノム医科学と新たな創薬体系
4. プロテオーム解析:多様な選択の分子設計
5. ゲノム・細胞操作とトランスレーショナル・リサーチ
6. 21世紀の発見型医療への国民の期待
7. 医科学における個人型研究と目的志向型研究
8. 基礎と臨床の橋渡しをする初期臨床開発
9. ゲノム創薬の経済考察とバイオベンチャーの役割
10.日本にベンチャーができない理由
11.先端医療開発ネットワークの構築
12.国際的互換性のある先端医療開発システムの構築
13.先端医療開発の総合戦略と提言
内容説明
ヒトゲノム配列のワーキングドラフトが2000年6月、国際共同ヒトゲノムプロジェクトチームとセレーラ社合同で発表された。ほぼ全てのヒト遺伝子の配列が明らかにされ、創薬の研究開発プロセスに大きなイノベーションの渦が引き起こされようとしている。本書は、このようなゲノム創薬の新潮流を引き寄せるため、一連の最新の研究を経験している研究者がわかりやすく最新のキーテクノロジーの解説をしたものである。
目次
第1章 ゲノム創薬の展望
第2章 ヒト長鎖cDNA解析
第3章 完全長cDNA技術
第4章 遺伝子発現頻度解析
DNAマイクロアレイ
第5章 核内タンパク質の移行メカニズムと発見技術
第6章 モデル生物ゲノム情報の利用とゲノム多型の解析
第7章 バイオインフォマティクス
第8章 プロテオーム解析
第9章 構造ゲノム科学
第10章 SELDIプロテインチップシステム
第11章 タンパク質結晶構造解析をめぐる技術の進歩と創薬
第12章 NMRによるタンパク質基本構造解析
第13章 ファーマコジェノミックスとSNPs
第14章 ヒトゲノム特許戦略
第15章 ゲノム医科学の展開と21世紀のゲノム医療の展望