内容説明
「マルチオミクス研究」を始めたい!あるオミクスで見えた生命現象の断面を,いかに他の階層の断面とつなぎ合わせ,全体像を掴むのか?マルチオミクスの考え方から,データ取得の実験ノウハウ,解析・統合のインフォマティクスまで.それぞれの状況に応じたアプローチと,オミクスデータの統合解析や技術拡張を紹介し研究を躍進させる1冊!
目次
【目次】
序
執筆者一覧
本書の使い方
第1章 マルチオミクス研究を始める前に
1. 本書の概要と,実験を始める前に考えること
2. マルチオミクス研究における解析戦略と環境整備
第2章 各オミクスによるデータ取得
1. ゲノム・エピゲノムのデータ取得
2. トランスクリプトームのデータ取得
3. 1細胞CRISPR解析によるデータ取得
4. Ribo-Seqのデータ取得
5. プロテオミクスのデータ取得
6. 1細胞グライコームのデータ取得
7. メタボロームのデータ取得
8. ノンターゲットリピドミクスのデータ取得
第3章 各オミクスにおけるデータ解析
1. ゲノム解析
2. CustardPyを用いたゲノム立体構造解析
3. scRNA-Seq解析
4. scATAC-Seqによる転写制御解析
5. マルチオミクス1細胞動態推定
6. 空間トランスクリプトーム解析
7. 1細胞摂動解析
8. メタボロームデータ解析と実験デザイン
9. メタゲノム解析
10. マルチオミクスデータの解析
第4章 各研究におけるマルチオミクス実験・解析の実例
1. 2型糖尿病に伴う糖代謝変化と制御のマルチオミクス解析
2. 循環器疾患のマルチオミクス解析
3. 脂肪細胞分化におけるマルチオミクス解析
4. 腫瘍微小環境におけるマルチオミクス解析
5. 長寿研究におけるマルチオミクス解析
6. 脳とマルチオミクス解析
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