実験デザインからわかる シングルセル研究実践テキスト - シングルセルRNA-Seqの予備検討から解析のコツ

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実験デザインからわかる シングルセル研究実践テキスト - シングルセルRNA-Seqの予備検討から解析のコツ

  • ISBN:9784758122702

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内容説明

シングルセル研究を始めることになったら?実験計画のポイント,サンプル調製,Seurat,Scanpyなど解析ソフトの実例コードや,外注の検討事項まで.全体の流れを把握して即戦力をつけたいあなたに!

目次

【目次】

執筆者一覧
本書の使い方

第1章 シングルセル解析をはじめる前に考えること
第2章 シングルセル解析実施前の予備検討:バルクRNA-Seq
第3章 公共データベースを用いた検討
第4章 シングルセル実験デザイン
第5章 サンプル調製
第6章 実験の基本フロー
第7章 データ解析の基本フロー
第8章 シングルセル転写開始点・エンハンサー解析
第9章 複数のシングルセルデータの統合
第10章 二次解析,グラフィカルな表現法,共有
第11章 CELLxGENEによるインタラクティブなデータ共有
第12章 解析結果の検証,解釈
第13章 受託解析を利用したシングルセル解析のすすめ
第14章 データ共有,代表的なポータルの紹介
座談会 エキスパートが語るシングルセル研究のリアル

索引