ロングリードWET&DRY解析ガイド シークエンスをもっと自由に! - リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de

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紙書籍版価格 ¥6,930
  • Kinoppy

ロングリードWET&DRY解析ガイド シークエンスをもっと自由に! - リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de

  • ISBN:9784758122535

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内容説明

精度が向上し,導入のしやすさや応用性の高さで新たな強みを示すロングリード技術を活用して新発見を掴むための実践プロトコール集.実例に裏打ちされたWET・DRY双方のノウハウが満載.

目次



第1章 Introduction
1 序論:誰もがゲノムシークエンシングできる時代に
2 ナノポアシークエンスの原理と技術発展
3 DRY解析環境のセットアップとデータ解析プラットフォームGalaxyの使い方
4 ナノポアシークエンス実践ガイド ライブラリプレップから解析環境選びまで

第2章 プロトコール1 リピートと構造変異
1 動物の長鎖リピート解析(クモ糸を例に)
2 ヒト疾患関連の長鎖リピート解析
3 ヒト疾患関連のSV解析
4 核酸の塩基修飾解析
5 メガベースをめざせ!ultra-long readプロトコール

第3章 プロトコール2 ゲノムアセンブリ
1 初めてでもできる!細菌ゲノムのアセンブル
2 和牛のde novoゲノムアセンブリ
3 ナノポアで読む植物ゲノム

第4章 発展的アプリケーション
1 direct RNA sequenceとRNA修飾の情報解析
2 ナノポア技術によるオンサイト迅速細菌同定
3 ナノポアシークエンサーMinIONを活用したウイルス解析

索引