シリーズUseful R 7 トランスクリプトーム解析

著者名：金明哲【編】/門田幸二【著】

共立出版（2021/09発売）

• ISBN：9784320123700

内容説明

トランスクリプトーム解析を行うための一連のスクリプト集である著者の2つのウェブページ『(Rで)マイクロアレイデータ解析』『(Rで)塩基配列解析』を体系的にまとめた本。データ取得、データ解析の基礎と応用がわかる。

目次

第１章　序論（マイクロアレイ
ＲＮＡ‐ｓｅｑ）
第２章　データ取得（マイクロアレイ
ＲＮＡ‐ｓｅｑ）
第３章　データ解析（基礎）（マイクロアレイ
ＲＮＡ‐ｓｅｑ）
第４章　データ解析（応用）（マイクロアレイ
ＲＮＡ‐ｓｅｑ）

感想・レビュー

※以下の感想・レビューは、株式会社ドワンゴの提供する「読書メーター」によるものです。

[Tsukasa Fukunaga]

Rを用いたトランスクリプトーム解析手法。データ取得から、正規化・クラスタリング・DEGの検出まで。ソースコードから統計学的概念まで、相当詳細な記載がなされており、また｢この部分はあまり気にしなくて良い｣といった実際の解析者がつまづきそうな部分へのアドバイスまで書かれており、解析する際には手元においておくと便利か。ただ、Rの本であるためか、基本的な解析については詳しいが、データの解釈や下流解析については全く触れられていないので注意が必要。また、非モデル生物の解析法についての言及はほぼない。

2014/05/27