User-Level Workflow Design : A Bioinformatics Perspective (Programming and Software Engineering)

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User-Level Workflow Design : A Bioinformatics Perspective (Programming and Software Engineering)

Lamprecht, Anna-Lena

ウェブストア価格 ¥10,769（本体¥9,790）
Springer-Verlag Berlin and Heidelberg GmbH & Co. K（2013/12発売）
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製本 Paperback:紙装版/ペーパーバック版／ページ数 223 p.
言語 ENG
商品コード 9783642453885
DDC分類 005.1

Full Description

The continuous trend in computer science to lift programming to higher abstraction levels increases scalability and opens programming to a wider public. In particular, service-oriented programming and the support of semantics-based frameworks make application development accessible to users with almost no programming expertise. This monograph establishes requirement-centric scientific workflow design as an instance of consequent constraint-driven development. Requirements formulated in terms of user-level constraints are automatically transformed into running applications using temporal logic-based synthesis technology. The impact of this approach is illustrated by applying it to four very different bioinformatics scenarios: phylogenetic analysis, the dedicated GeneFisher-P scenario, the FiatFlux-P scenario, and microarray data analyses.

The Bio-jETI Framework.- Phylogenetic Analysis Workflows.- GeneFisher-P.- FiatFlux-P.- Microarray Data Analysis Pipelines.