出版社内容情報
☆ポスト・ゲノム解析の主要技術，DNAチップ！！
☆DNAチップの作成から読み取り，解析までを詳述！！
☆医療，医薬，診断，環境など多岐に亘る応用を網羅！！
執筆者一覧（執筆順）
松永 是 東京農工大学 工学部 生命工学科 教授
神原 秀記 （株）日立製作所 中央研究所 技師長
釜堀 政男 （株）日立製作所 中央研究所 バイオシステム研究室 主任研究員
川口 竜二 （株）エスアールエル 遺伝子・染色体解析センター 研究開発課 責任者
大竹 久夫 広島大学大学院 先端物質科学研究科 分子生命機能科学専攻 教授
滝口 昇 広島大学大学院 先端物質科学研究科 分子生命機能科学専攻
久原 哲 九州大学大学院 農学研究院 教授
高橋浩二郎 広島国際大学 保健医療学部 教授
竹山 春子 東京農工大学 工学部 生命工学科 助教授
竹中 繁織 九州大学大学院 工学研究科 化学システム工学専攻 応化分子教室
澤上 一美 プレシジョン・システム・サイエンス（株）
田島 秀二 プレシジョン・システム・サイエンス（株） 代表取締役
養王田正文 東京農工大学 工学部 生命工学科 助教授
福島 雅夫 （株）エスアールエル 遺伝子・染色体解析センター 研究開発課
馬場 嘉信 徳島大学 薬学部 教授
有國 尚 サイファージェン・バイオシステムズ（株）鎌倉研究所 所長
斉藤 賢治 サイファージェン・バイオシステムズ（株）鎌倉研究所
大門 尚志 宝酒造（株） 主任研究員
鈴木 定彦 大阪府立公衆衛生研究所
市原 竜生 日清紡（株） 研究開発センター
田丸 亜貴 大阪府立公衆衛生研究所
アミン・ルフル 大阪府立公衆衛生研究所
勝川 千尋 大阪府立公衆衛生研究所
牧野 正直 国立療養所 久光明園
阿部千代治 結核予防会 結核研究所
加藤 貴彦 宮崎医科大学 医学部 公衆衛生学講座
今井 博久 米国ジョージア州立医科大学 医学部
村上 康文 東京理科大学 基礎工学部 生物工学科 ゲノム生物学研究室 教授
河原林 裕 通商産業省 製品評価技術センター バイオテクノロジーセンター
DNA解析技術調整官
今本 文男 ライフテックオリエンタル（株） 科学技術顧問
高橋 勝利 北陸先端科学技術大学院大学 知識科学研究科
構成および内容
第１章 DNAチップと応用 松永 是
第２章 DNA計測技術の動向 神原秀記，釜堀政男
１はじめに
２応用面からみたDNA計測とDNA計測法
３最近話題のDNA計測法
3.1 キャピラリーアレー電気泳動装置
3.2 電気泳動チップ
3.3 DNAチップ
3.4 ビーズ技術
3.5 質量分析
3.6 パイロシーケンシング
第３章 DNAチップの開発動向 川口竜二
１はじめに
２DNAチップ法と遺伝子解析プロセス
３DNAチップ解析の各工程における技術開発
４DNAチップの現状と方向性
第４章 生命体ソフトウェアの開発 大竹久夫，滝口 昇
１はじめに
２大腸菌とゲノム情報
３バーチャル大腸菌システム
3.1 大腸菌の機能ルールとRuleKB
3.2 機能ルールを呼び出すためのルール
４Vestの実行例
第５章 DNAマイクロアレイの実際技術とその応用 久原 哲
１はじめに
２マイクロアレイの技術
2.1 マイクロアレイの基本技術
2.2 マイクロアレイの実際
（１）マイクロアレイ用DNAの調整
（２）RNA試料からのターゲット調整
（３）マイクロアレイの作製およびハイブリダイゼーション
（４）スポットの定量
３チップの応用
RNA発現解析／DNAへの応用
４今後の展開
第６章 ダイヤモンドを用いた保存型DNAチップ 高橋浩二郎
１はじめに
２なぜ，ダイヤモンド？
３オリゴDNAの固定化
４cDNAライブラリーの固定化
５二本鎖DNAの固定化
６二本鎖cDNAライブラリーの考察
７固定化gDNAチップとレプリカ・チップの考察
８バーチャル自動遺伝子診断装置
９将来の展望
第７章 磁気ビーズ利用DNAチップ
竹山春子，中山秀喜
１. はじめに
２. 従来型DNAチップ
３. ビーズを用いた遺伝子検出
４. DNA固定化磁性細菌微粒子を用いた遺伝子検出法
4.1 種特異的DNAプローブ固定化磁性細菌微粒子を用いたマグロ魚種判別
4.2 磁気ビーズマイクロアレイ
第８章 電気化学法によるDNA検出 竹中繁織
１新規DNA結合性リガンドの開発
２検出装置と測定
３DNAプローブ修飾電極の作成
４ハイブリダイゼーション反応
５DNA検出例
5.1 オリゴヌクレオチドの検出
5.2 プラスミドDNA上の目的遺伝子配列の検出と定量
６検出操作の簡略化
７超高感度化
８PCR産物の検出例
９DNAマイクロアレイへの応用
第９章 自動装置 澤上一美，田島秀二
１はじめに
２DNAチップ技術の基本
３一貫した自動化システム構築への将来展望
第10章 マイクロマシンによるDNA解析 養王田正文
１はじめに
２電気泳動とPCRのマイクロ化
３集積化DNA解析チップ
４DNA解析をマイクロ化することのメリットとデメリット
第11章 医療計測への応用 川口竜二，福島雅夫
１病原微生物同定解析への応用
２シゲラ，サルモネラ菌のDNAチップ法による検出・同定
３発現解析の診断への応用
４遺伝子変異解析への応用
５BACライブラリーチップの染色体異常解析への応用
第12章 SNPs（一塩基多型）解析 馬場嘉信
１はじめに
２ゲノムシークエンシングからSNP解析へ
３DNAチップによるSNP解析
４集積型マイクロチップによるSNP解析
第13章 SELDIプロテインチップRシステムによるバイオマーカー探索技術
有國 尚，斉藤賢治
１はじめに
２SELDIプロテインチップ技術
３タンパク質バイオマーカーの探索と分析の手法
４SELDIプロテインチップ技術を用いたマーカー探索
５SLEDIプロテインチップを用いたマーカー探索の応用例
前立腺ガン／神経膠腫
６プロテオーム解析の現状と問題点
第14章 遺伝子発現プロファイリング 大門尚志
１はじめに
２DNAチップの原理
３DNAチップのための装置とソフトウェア
3.1 DNAチップ作製装置
3.2 DNAチップ読み取り装置
3.3 データ解析ソフト
3.4 DNAチップ
４DNAチップを用いた遺伝子発現モニタリング
4.1 DNAチップ
4.2 発現実験の手順
4.3 データ解析
５DNAチップの応用と課題
第15章 結核菌の耐性診断 鈴木定彦，市原竜生，田丸亜貴，アミン・ルフル，
勝川千尋，牧野正直，阿部千代治
１はじめに
２結核菌の多剤耐性獲得機序
３結核菌薬剤耐性に関与する遺伝子
3.1 イソニアジド（INH）耐性
3.2 リファンピシン（RFP）耐性
3.3 ピラジナミド（PZA）耐性
3.4 エタンブトール（EB）耐性
3.5 ストレプトマイシン（SM）耐性
3.6 カナマイシン（KM）耐性
3.7 その他の薬剤に対する耐性に関与する遺伝子
４これまでの遺伝子工学的手法による結核菌の耐性迅速診断
５DNAチップによる薬剤耐性結核菌の迅速鑑別
第16章 環境ゲノム 加藤貴彦，今井博久
１はじめに
２疫学と分子疫学
３発癌感受性素因について
４尿路上皮癌の発癌感受性素因
５分子疫学研究の予防医学的意義
６発癌感受性研究の問題点
７DNAチップ技術への期待
第17章 出芽酵母遺伝子のマイクロアレイによる発現解析 村上康文
１はじめに
２出芽酵母における遺伝子発現プロフィールの解析
３オリゴDNAマイクロアレイによる遺伝子発現プロフィールの解析
４マイクロアレイシステムの改良の試み
第18章 好熱古細菌ゲノム解析 河原林 裕
１はじめに
２世界での好熱菌ゲノム解析
３解析対象とした超好熱古細菌
４好熱菌ゲノムの全塩基配列決定
５ゲノム解析結果
６各菌のゲノム解析から明らかとなった特長
７古細菌間のゲノム比較
８ゲノム解析データの利用－新規機能の探索－
９ゲノム解析データの利用－機能解析に向けて－
10ゲノム解析の今後
第19章 cDNAライブラリー 今本文男
１はじめに
２発現遺伝子のcDNA作製
３細胞の発現遺伝子像を反映するcDNAライブラリー
４cDNAライブラリーのrare cDNA濃縮
５cDNAライブラリーのrare cDNA捕捉
６完全長cDNAライブラリー作製
第20章 ２D－PAGE画像処理におけるBioinformaticsの重要性 高橋勝利
１はじめに
２２D－PAGEによるプロテオーム解析
2.1 ２D－PAGEによる蛋白質分解
2.2 質量分析による蛋白質スポットの同定
2.3 ２D－PAGEマップの比較によるプロテオーム解析
３２D－PAGE画像のコンピュータ画像処理
3.1 スポットの自動認識と形状推定
3.2 スポットパターンの自動照合
3.3 マスタースポットパターンの自動生成
内容説明
本書は、ＤＮＡチップの開発動向から、検出系・装置の動向、そして多岐にわたる応用までを各分野の第一線で活躍中の執筆者たちが執筆している。また、ＳＮＰｓ、プロテオーム解析、バイオインフォマティクスなど、今後の主要技術の展望についてもふれられている。バイオ、医療、エレクトロニクス分野はもとより、ＤＮＡチップ技術に興味をお持ちの方々すべてに最新の情報を提供するものである。
目次
総論編（ＤＮＡチップと応用；ＤＮＡ計測技術の動向；ＤＮＡチップの開発動向 ほか）
ＤＮＡチップ・装置編（ＤＮＡマイクロアレイの実際とその応用；ダイヤモンドを用いた保存型ＤＮＡチップ；磁気ビーズ利用ＤＮＡチップ ほか）
応用編（医療計測への応用；ＳＮＰｓ（一塩基多型）解析
ＳＥＬＤＩプロテインチップシステムによるバイオマーカー探索技術 ほか）
