出版社内容情報
ＵＮＩＸの使い方から配列解析、構造解析に必要なデータベースおよびツール群まで紹介している。
●生命の知を探る
生命に対する人類の関心の始まりは、知の誕生とともに古い昔に遡るであろう。長い遍歴を経た後、今日のわれわれは、遺伝子レベルで生命の知を発見するための道具を持つに至った。
われわれは、知識科学が拓く多様な研究領域を見てきた。しかし、これまでの旅程は、諸科学の再編・統合を目指す知識科学という企てにとって、まだ始まりに過ぎない。微視的な視点からの探求は、遺伝子レベルでの知のエレメントの発見にまで及び、他方、巨視的な視点からの探求は、国ないし地球規模で知を活用するためのメソドロジーをも包括するであろう。知ることへの欲求が終わらない限り、それらを横断する知識科学のフロンティアも拡張し続ける。新しい研究領域への遍歴の叙事詩が始まる。
内容説明
ポストシークエンス技術やゲノム研究において、もはやコンピュータのサポートなしでの作業は考えられない。本書は、ゲノム研究の最前線で有用なソフトウェアやデータベースの活用法を実践的なアプローチで解説する。Ｌｉｎｕｘマシンのインストール方法や便利なコマンドの解説に始まり、実際のデータ解析や研究課題に沿った形で、データベースや関連ウェブサイトを紹介し、解析ソフトウェア、データベースシステムなどの機能や使い方を詳しく掘り下げる。
目次
１部 序章（コンピュータ時代の生物学；生物学的問題のコンピュータ的解法）
２部 ワークステーション―システム環境（ワークステーションのセットアップ；Ｕｎｉｘのファイルとディレクトリ ほか）
３部 作業ツール群（生物学研究に役立つウェブ；シークエンス解析、ペアワイズアラインメント、データベースサーチ ほか）
４部 データベースおよび視覚化（Ｐｅｒｌを用いてデータ解析を自動化する；生物学データベースを構築する ほか）
著者等紹介
ギバス，シンシア［ギバス，シンシア］［Ｇｉｂａｓ，Ｃｙｎｔｈｉａ］
バージニア工科大学生物学部助教授。コンピュータによる生物学が盛んになる以前からのコンピュータ生物学者である。最近では、作ったばかりの自家製Ｌｉｎｕｘクラスターを動かすことを勉強中。専攻は、ゲノム構造、ゲノム進化、タンパク質の表層や接触面の特性、タンパク質構造の予測などの研究である。現在は、生物学者向けのバイオインフォマティクス入門コースを教えている
ジャンベック，パー［ジャンベック，パー］［Ｊａｍｂｅｃｋ，Ｐｅｒ］
カリフォルニア州立大学サンディエゴ校生物工学部学生。博士。１９９４年からコンピュータ生物学問題に従事し、多次元の生物学データを識別するアプリケーションを学びつつマシンに向かっている
水島洋［ミズシマヒロシ］
専門は、バイオインフォマティクス、分子生物学、医療情報学、東大薬学部では酵素精製とクローニング（配列解析はＭａｘａｍ‐Ｇｉｌｂｅｒｔ法）、国立がんセンターではウィルス感染による宿主遺伝子の発現変化の研究を行った後、医療施設間ネットワークとスーパーコンピュータプロジェクトに従事。バーチャルリアリティを用いた分子モデリングなども行っている。主たる研究はゲノム情報の発現制御システムの解明。２０００年８月より客員研究員としてＮＣＢＩに留学。疾病ゲノムセンター併任
明石浩史［アカシヒロフミ］
専門は分子生物学、消化器内科学と医療情報学。札幌医科大学大学院で４年間、東京大学医科学研究所で２年間、遺伝子ハンティングを中心とした分子生物学の研究に従事し、その中でバイオインフォマティクスの重要性、必要性を痛感した。現在札幌医大附属情報センターにてオリジナルのゲノムシークエンス解析ツールの開発に従事している
またぬき［マタヌキ］
医師であり、Ｌｉｎｕｘ ｋｅｎｒｅｌやＩＰｖ６のハッカーでもある。Ｄｅｂｉａｎ‐ＪＰプロジェクト、Ｄｅｂｉａｎプロジェクトに所属。ＬｉｎｕｘのＩＰｖ６機能をサポートするＵＳＡＧＩ ｐｒｏｊｅｃｔにｎｅｔｆｉｌｔｅｒｖ６のｌｏｇｇｉｎｇ機能の修正を提供している。また、ネットニュースサーバＩＮＮのＩＰｖ６化においてハッカー、テスターとして貢献している。Ｌｉｎｕｘ関係のドキュメントではＪＦの「Ｌｉｎｕｘ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ ＨｏｗＴｏ」の日本語訳に助言を与えた。Ｄｅｂｉａｎパッケージ「ｉｐｖ６ｃａｌｃ」のメンテナでもある。日本学術振興会産学協力委員会インターネット技術第１６３委員会（ＩＴＲＣ）では第１０回研究会のｐｒｏｇｒａｍ ｃｏｎｄｕｃｔｏｒを勤めた
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